подскажите пожалуйста с чем может быть связано, как исправить?
Скорее всего на объектах присутствует непропорцианальное изменение масштаба, примените Scale объекта (ctrl+a) или выставьте галочк на объекте Apply Scale and Modifiers.
Blend4Web и всё такое. Тридешу тридэ, моделю модели.